東方肝膽外科醫(yī)院是以肝膽外科為特色的三級甲等綜合醫(yī)院，建筑面積20萬平方米，展開床位1500張，是國內(nèi)一次建成體量最大的醫(yī)院?，F(xiàn)為國家重點學科，國家級繼續(xù)醫(yī)學教育基地，全軍肝膽外科?？浦行模姼文懲饪蒲芯克?，國家教育部和全軍重點實驗室，軍隊“重中之重”建設學科，上海市醫(yī)學領先專業(yè)重點學科，上海市重中之重臨床醫(yī)學中心。

醫(yī)院長期堅持醫(yī)、教、研相結合，在原發(fā)性肝癌的早期診斷和治療，中晚期肝癌的綜合治療，原發(fā)性肝癌術后抗復發(fā)治療，腫瘤的免疫治療、介入治療，復雜膽道疾病的手術治療，肝膽疾病的內(nèi)窺鏡治療以及肝移植等方面均居國內(nèi)外先進水平。不僅采用傳統(tǒng)的外科手術治療方法，還采取了細胞治療、微波方法、射頻方法、氬氦刀方法、激光光敏技術、肝內(nèi)腫瘤酒精注射療法和經(jīng)股動脈至肝動脈插管加栓塞療法等。

于2015年10月18日試運行的安亭新院，是國內(nèi)先進的研究型醫(yī)院，在保持現(xiàn)有特色學科的基礎上，建設內(nèi)科等支撐學科，發(fā)展其他外科和專科，是一所設計理念先進、功能布局科學、醫(yī)療技術領先的三級甲等現(xiàn)代化綜合性醫(yī)院。作為第二軍醫(yī)大學實現(xiàn)“一體兩翼”戰(zhàn)略布局的“先鋒隊”，醫(yī)院匯聚了以長海醫(yī)院急診科主任何建、骨科教授康一凡、長征醫(yī)院心內(nèi)科教授趙學為代表的近30名各學科領軍人物傾情加盟，給肝膽外科以強有力的支撐。醫(yī)院擁有上海首臺第五代射波刀系統(tǒng)等國際一線品牌的大型檢查檢驗設備，30間手術室全部為空氣凈化手術室，是國內(nèi)一次性建成手術室最多的單體建筑。

與醫(yī)院毗鄰的國家肝癌科學中心是由吳孟超院士和我國精準治療的領軍人物王紅陽院士牽頭成立的國家級肝癌研究中心，這個中心將以安亭新院為依托，緊緊圍繞降低我國肝癌發(fā)病率、病死率的目標，精準聚焦肝癌研究領域的重大科技關鍵問題，開展肝炎、肝硬化向肝癌發(fā)展的預警與預防等轉化醫(yī)學研究，并為肝膽腫瘤的精準治療提供支持，成為國內(nèi)轉化醫(yī)學和精準治療新高地。

醫(yī)院擁有一支由吳孟超院士領銜，以拔尖中青年為骨干的優(yōu)秀科技干部隊伍，現(xiàn)有中國科學院院士1名，中國工程院院士1名，博士生導師33名，碩士生導師80名，高級職稱90名。1978 年以來，共培養(yǎng)博士后22 名，博士研究生112名，碩士研究生223名，并承擔外國留學生、本科、大專、中專等教學任務，多年來還為全國各地培養(yǎng)進修生千余名，是國內(nèi)培養(yǎng)肝膽外科高層次人才的教學基地。1996年1月，中央軍委授予吳孟超院長“模范醫(yī)學專家”榮譽稱號。近年來，醫(yī)院有1人入選長江學者獎勵計劃特聘教授，2 人入選國家“百千萬”人才工程，1 人獲中國有突出貢獻博士，2人獲全國“巾幗建功”標兵，3人獲全軍“育才獎”金獎，22人獲全軍“育才獎”銀獎，2 人獲總后“一代名師”、7人當選總后科技“金星”、“銀星”、“新星”人才，4人獲上海市“科技精英”稱號，5人獲上海市“銀蛇獎”，1人獲“上海教育功臣”榮譽稱號，1人獲軍隊專業(yè)技術重大貢獻獎，8人享受政府特殊津貼。