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腸結(jié)核需要與克羅恩病、右側(cè)結(jié)腸癌、潰瘍性結(jié)腸炎、阿米巴病或血吸蟲病性肉芽腫鑒別。

1、克羅恩病：不伴肺結(jié)核或其他腸外結(jié)核病變，病情呈緩解和復(fù)發(fā)交替；糞便反復(fù)檢查找不到結(jié)核桿菌；X線病變主要發(fā)生在回腸末端，呈節(jié)段性分布；出現(xiàn)并發(fā)癥較腸結(jié)核更為常見；抗結(jié)核治療無效，手術(shù)切除標(biāo)本找不到結(jié)核證據(jù)?？赏ㄟ^以上鑒別診斷。

2、右側(cè)結(jié)腸癌：本病常見40歲以上人群，病程呈進行性發(fā)展，貧血、消瘦較明顯，一般無結(jié)核毒血癥表現(xiàn)，X線氣鋇雙重造影時，可見結(jié)腸充盈缺損，腸腔狹窄和黏膜破壞。病變范圍較局限，血清癌胚抗原含量可增高，結(jié)腸鏡檢查及活檢較易確診。

3、潰瘍性結(jié)腸炎：本病腹痛較輕，以左下腹為主，病變主要位于乙狀結(jié)腸和直腸，腸道黏膜主要表現(xiàn)為彌漫性炎癥。通過體格檢查等可鑒別。

4、阿米巴病或血吸蟲病性肉芽腫：本病既往有相應(yīng)感染病史，無結(jié)核病史，膿血便常見，糞便常規(guī)或孵化檢查可發(fā)現(xiàn)有關(guān)病原體，結(jié)腸鏡檢查多有助于鑒別診斷。相應(yīng)特效治療有效，抗結(jié)核治療無效。