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肺癌分為小細胞癌和非小細胞癌，非小細胞癌又包括鱗癌、腺癌、大細胞癌等，每一種癌癥可以有不同的免疫組化的抗體對其進行標識。

鱗癌應用的免疫組化抗體包括P40、P63、CK56，是對鱗癌的特異性標志，如果以上抗體陽性，則是鱗癌。腺癌經常標記的抗體是CK7、TTF-1、NaspinA、SPA、SPB，是腺癌特異性標記抗體，如果以上抗體是陽性，可以診斷為腺癌。小細胞癌的特異性標記抗體是Syn、CgA、CD56，如果這幾個標記抗體陽性，可以確診為小細胞癌。