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病毒性腦炎的恢復(fù)，每個(gè)人情況不同。病毒引起炎癥反應(yīng)，對(duì)腦組織造成的損害程度不同，預(yù)后也不同。若病毒性腦炎只影響少數(shù)腦組織或只影響到腦膜，在臨床急性期只有頭暈、頭疼或發(fā)熱，無特別嚴(yán)重神經(jīng)功能缺損，經(jīng)過積極抗病毒治療或減輕炎癥反應(yīng)治療2-3周或出院后不再有其它神經(jīng)功能缺損癥狀，也不再?gòu)?fù)發(fā)，預(yù)后比較好，也恢復(fù)較快。

部分病人病毒損害較嚴(yán)重，在急性期有高熱、意識(shí)障礙、神經(jīng)功能缺損也較嚴(yán)重以及癲癇發(fā)作，且病毒對(duì)腦細(xì)胞破壞較嚴(yán)重或神經(jīng)細(xì)胞炎癥反應(yīng)和損傷、水腫都較嚴(yán)重，即使經(jīng)過積極治療也會(huì)遺留后遺癥。有些病人會(huì)出現(xiàn)神經(jīng)功能損失、認(rèn)知功能障礙或運(yùn)動(dòng)功能障礙，因此預(yù)后和自身病情有一定相關(guān)性。