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牙石的形成包括三個基本步驟，即獲得性薄膜形成、菌斑成熟和礦物化。前兩個步驟實際上即菌斑的形成過程，齦上結石和齦下牙石的礦化成分，分別來源于唾液和齦溝液。在礦化過程中，晶體先在細胞間的基質(zhì)和細菌表面形成，最后可進入細菌。牙結石由菌斑和軟垢鈣化而成，在菌斑形成的2-14天中都可以進行礦化，從開始礦化到牙石形成，快者10天，慢者20天左右，平均約12天。
并非所有的菌斑都一定會變成牙石，不鈣化的牙菌斑在形成兩天時，礦物質(zhì)含量達到頂點以后就不再增加。鈣化最初沿著菌斑附著在牙表面，由里向外層層發(fā)展和牙面平行。隨著鈣化過程，膜被包埋，牙齒間的線稱為增長線，是牙齒生長和增加新層的證據(jù)，牙齒表面粗糙，因此很容易有菌斑。