解放軍總醫(yī)院第七醫(yī)學(xué)中心消化內(nèi)科醫(yī)學(xué)部前身是原解放軍總醫(yī)院消化內(nèi)科，始建于1958年，是中華醫(yī)學(xué)會(huì)消化病分會(huì)主任委員、中華醫(yī)學(xué)會(huì)消化內(nèi)鏡學(xué)分會(huì)主任委員所在單位。2008年被評(píng)為北京市重點(diǎn)學(xué)科，2013年被評(píng)為全軍首批國(guó)家臨床醫(yī)學(xué)專科中心建設(shè)單位。醫(yī)學(xué)部2020年6月成立，包含消化內(nèi)鏡超級(jí)微創(chuàng)與修復(fù)（消化軍事醫(yī)學(xué)）、食管胃、腸道、肝臟，膽系、胰腺疾病及腸道微生態(tài)等亞專業(yè)，擁有7個(gè)派駐科室，現(xiàn)有高職專家70名，醫(yī)護(hù)人員430人。在消化系統(tǒng)常見病，疑難病診治和急危重癥救治方面特色鮮明，擁有在面積、規(guī)模、技術(shù)等方面領(lǐng)先世界的國(guó)際一流消化內(nèi)鏡中心。醫(yī)學(xué)部在國(guó)際率先定名完善了消化內(nèi)鏡隧道技術(shù)，替代了一批傳統(tǒng)外科手術(shù)，降低了手術(shù)風(fēng)險(xiǎn)、提高了術(shù)后生活質(zhì)量；率先提出基于保持人體解剖結(jié)構(gòu)不變條件下，達(dá)到祛除疾病目的的超級(jí)微創(chuàng)手術(shù)新概念，替代以切除器官為代價(jià)的手術(shù)模式，為未來手術(shù)方法學(xué)與器械研發(fā)指明了方向。在腸道微生態(tài)與腫瘤表觀遺傳學(xué)研究方面也處于國(guó)際國(guó)內(nèi)領(lǐng)先地位。科研成果包括國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)、軍隊(duì)科技進(jìn)步和醫(yī)療成果一等獎(jiǎng)、北京市醫(yī)學(xué)科技一等獎(jiǎng)、美國(guó)胃腸病學(xué)會(huì)主席團(tuán)獎(jiǎng)及唯一國(guó)際獎(jiǎng)、吳階平醫(yī)藥創(chuàng)新獎(jiǎng)，吳階平—保羅楊森醫(yī)藥獎(jiǎng)。