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系統(tǒng)性紅斑狼瘡具有一定遺傳傾向，與遺傳背景相關(guān)，但與紅綠色盲等單基因遺傳病完全不同。雖然在已經(jīng)完成的全基因組掃描中發(fā)現(xiàn)較多的易感基因，但并不意味著患者父母、兄弟姐妹或其他有血緣關(guān)系的人一定會(huì)發(fā)生系統(tǒng)性紅斑狼瘡，可能只是存在一些易感基因。

紅斑狼瘡的發(fā)生機(jī)制較為復(fù)雜，除遺傳背景外，在病毒感染、激素水平異常等多因素作用下如果引起免疫紊亂，尤其是T細(xì)胞、B細(xì)胞等免疫細(xì)胞的紊亂，造成細(xì)胞因子釋放、免疫球蛋白生成、自身抗體合成等，進(jìn)而還可以激活補(bǔ)體，導(dǎo)致組織器官損傷，從而出現(xiàn)一系列的臨床表現(xiàn)。