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行胃鏡檢查一般不會傳染疾病。胃鏡的洗消有全國統(tǒng)一、嚴格的規(guī)范與標準，在做胃鏡之前，所有患者均要常規(guī)進行傳染性疾病的檢查，比如乙肝、丙肝、艾滋病、梅毒，會在術(shù)前進行檢查。傳染病患者，會使用專門的檢查器械以及洗消流程。

消化道是一個清潔的環(huán)境，但不是無菌的環(huán)境，患者進食的食物也并非無菌，因此使用的胃鏡保持清潔即可，不要求無菌。臨床做胃鏡檢查較為安全，一般不會出現(xiàn)傳染病的問題。