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目前臨床上用于治療結腸癌的化療藥物主要包括氟尿嘧啶、卡培他濱、奧沙利鉑、伊立替康、雷替曲塞等，其中氟尿嘧啶是治療結腸癌的基礎用化療藥物，很多藥物均是氟尿嘧啶的衍生物。
應用氟尿嘧啶后常見的嚴重不良反應是心臟的毒性，對于既往有心臟病基礎病患者應該謹慎用藥，必要時需要換用雷替曲塞來進行抗腫瘤治療。
卡培他濱用藥后常見的不良反應是手足綜合征，奧沙利鉑屬于第三代鉑類的抗腫瘤化療藥物，用藥后常見的不良反應是神經(jīng)系統(tǒng)的不良反應，在用藥后要囑患者避免接觸涼性物體。
伊立替康用藥后常見的不良反應是腹瀉，嚴重的甚至危及生命，因此在用藥前需要抽血化驗以預測發(fā)生腹瀉的風險。