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系統(tǒng)性紅斑狼瘡是一種病因不明的，累及多器官、多系統(tǒng)的結締組織疾病，雖然病因尚未完全明了，但目前的研究認為可能與下列因素有關：
第一、遺傳因素，系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病有家族聚集傾向，遺傳概率大概是43%左右，目前通過遺傳學的方法已經(jīng)確定了多個系統(tǒng)性紅斑狼瘡的易感基因。
第二、性激素，系統(tǒng)性紅斑狼瘡多見于育齡期的女性，妊娠可以誘發(fā)或加重系統(tǒng)性紅斑狼瘡。
第三、環(huán)境因素以及其它因素，紫外線照射可以使狼瘡加重或誘發(fā)。除此之外，某些藥物例如甲基多巴、異煙肼、青霉素和生物制劑也可以誘發(fā)藥物性的紅斑狼瘡。感染例如鏈球菌的感染、EB病毒的感染，也可以誘發(fā)或加重本病。
綜上所述狼瘡的發(fā)病與患者自身的遺傳易感性有關，也與患者個人的免疫異常有關，在遺傳易感的基礎上，多種環(huán)境因素導致患者自身免疫相關基因過度表達，體內(nèi)產(chǎn)生多種自身抗體，這些抗體通過超敏反應引起多器官、多系統(tǒng)的損傷，從而導致狼瘡的發(fā)生與發(fā)展。