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氨代謝紊亂引起氨中毒是肝性腦病，特別是門體分流性肝性腦病的重要發(fā)病機制。這是因為消化道是氨產(chǎn)生的主要部位，被吸收后通過門脈系統(tǒng)進入體循環(huán)。健康的肝臟可將門靜脈輸入的氨轉變?yōu)槟蛩?、谷氨酰胺，使之極少進入體循環(huán)。肝衰竭時，肝臟對氨的代謝能力明顯減退，當有門體分流存在時，腸道的氨不經(jīng)肝臟代謝直接進入體循環(huán)，使血氨增高，就會使游離的氨透過血-腦屏障，產(chǎn)生腦功能各方面的障礙，這就是肝性腦病發(fā)病的主要機制。
一般氨進入腦內可以干擾腦細胞、三羧酸循環(huán)，使大腦細胞的能量供應不足，會使腦內對一些氨基酸的攝取增加，比如色氨酸、酪氨酸等，對腦功能具有抑制作用。同時腦星形膠質細胞中有谷氨酰胺合成酶，當腦內氨濃度增加時，谷氨酰胺將合成增加，會使腦細胞發(fā)生水腫。氨可以直接干擾神經(jīng)的電活動，通過這些機制會出現(xiàn)肝性腦病的癥狀。