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肺結節(jié)病是一種原因不明的、多系統(tǒng)累及的肉芽腫性疾病，主要侵犯肺和淋巴系統(tǒng)，再就是眼和皮膚，目前認為病因主要有以下幾種：
1、遺傳因素，肺結節(jié)病的臨床表型以及患病的種族差異，提示遺傳因素的作用，家族和病例對照研究證實，與肺結節(jié)病易感和表型關系最為密切的基因，位于6號染色體的MHC區(qū)，其他候選基因如細胞因子、化學趨化因子受體等均不具備可重復性，功能的有效性未得到證實。
2、環(huán)境因素，伯氏疏螺旋體、痤瘡丙酸桿菌、結核及其他分枝桿菌等，作為肺結節(jié)病的可能病因沒有被證實，迄今沒有感染性病因或其他因素被一致證明與肺結節(jié)病的發(fā)病相關。
3、免疫機制，肺結節(jié)病已受累臟器，尤其是肺臟的非干酪樣壞死性肉芽腫為病理特點，病變組織聚集大量的激活的Th1型CD4-T淋巴細胞，和巨噬細胞是其特征性免疫異常的表現。
肺結節(jié)病的確切發(fā)病機制還不清楚，目前觀點是遺傳易感者受特定的環(huán)境抗原刺激，遞呈細胞吞噬處理抗原，經Ⅱ類白細胞相關抗原分子傳遞到CD4細胞的T細胞受體，誘發(fā)受累臟器局部產生Th1型免疫反應，導致細胞聚集、增生、分化和肉芽腫形成，同時產生的白介素-2、白介素-12、白介素-18、γ干擾素、腫瘤壞死因子α等細胞因子和化學趨化因子，促進肉芽腫形成。