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醫(yī)院感染也可以稱為醫(yī)院內感染、院內感染或醫(yī)院獲得性感染。中國2001年統(tǒng)一定義為醫(yī)院感染，主要是指住院患者在醫(yī)院內獲得的感染，包括在住院期間發(fā)生的感染和在醫(yī)院內獲得，出院以后又發(fā)生的感染，但不包括入院前已經開始或入院時已存在的感染。
醫(yī)院工作人員在醫(yī)院內獲得的感染，也屬于醫(yī)院感染。它可以分為外源性感染和內源性感染，外源性感染又稱為交叉感染，是指攜帶病原體的醫(yī)院內患者、工作人員以及探視者，以及醫(yī)院環(huán)境中細菌的侵襲或定制造成的感染。
內源性感染也可以稱為自身感染，是指患者自身的皮膚、口腔、咽部和胃腸道等處寄生的正常菌群，由于數(shù)量或者寄生部位的改變而引起的感染。