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臨床要根據(jù)患者的不同臨床癥狀和病史選擇合適的檢查，有的患者需要做核磁共振檢查，有的需要做CT檢查，核磁共振檢查目前幾乎可以用于全身各個部位，常見的需要做核磁共振檢查的情況如下：
1、中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變：包括腦和脊髓，核磁檢查最先用于顱腦病變，對于先天性發(fā)育畸形、腦梗死、腦腫瘤、腦代謝性疾病、腦炎和腦膿腫具有明顯優(yōu)勢。腦梗死早期CT上可能無改變，但核磁共振能檢測到早期腦梗死，這一點優(yōu)于CT。但如果懷疑有腦出血或腦外傷的患者，建議首選CT；
2、骨關(guān)節(jié)系統(tǒng)病變：可以顯示骨質(zhì)結(jié)構(gòu)，比如骨折，首選還是X線或CT檢查，但對于顯示各部位關(guān)節(jié)軟骨、韌帶、肌肉損傷、骨挫傷、關(guān)節(jié)炎、椎間盤突出、椎管狹窄以及椎管內(nèi)占位，核磁共振檢查優(yōu)于CT；
3、腹部疾?。喊ǜ闻K、膽囊、胰腺、脾臟、雙腎、腎上腺、膀胱及前列腺等器官病變，還有腹膜后各種病變及轉(zhuǎn)移性病變，核磁共振具有優(yōu)勢；
4、生殖系統(tǒng)疾?。号宰訉m、宮頸、卵巢腫瘤的診斷和分期、妊娠期胎盤位置及胎盤植入情況、胎兒發(fā)育情況評估，都可以選擇磁共振，也可以選擇超聲檢查。
此外，有一些病變不建議首選磁共振檢查，如肺內(nèi)病變、食管病變、胃腸道病變以及外傷等。當(dāng)然，磁共振檢查不是萬能的方式，各種影像檢查都有其優(yōu)缺點，所以并不是每個部位都做核磁共振檢查最好，要根據(jù)病情，由醫(yī)生來選擇適合的檢查方法。