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質子治療脊索瘤比單獨常規(guī)放療可能更為有效。因為脊索瘤對于一般的放療不是非常敏感，雖然目前推薦脊索瘤的治療方法為手術切除輔以放射治療，但是，質子束療法可能更為有效。但是，質子束治療需要到少數有回旋加速器的單位實施，由于所采用的階梯療法通常大約需要七周左右時間，因此可能難以安排。如果有條件用質子束治療脊索瘤，可以考慮選用該方案。由于脊索瘤患者平均壽命大約為6.3年左右，對于沒有經過任何治療的脊索瘤患者，壽命不會超過2年，因此，對于脊索瘤的治療需要采取積極可行的治療方案，這樣才能提高患者的生存率。