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鼠疫的臨床分型主要是根據鼠疫桿菌侵犯的部位不同，進行臨床分型，具體如下：
第一、腺鼠疫，是臨床最多見的一種類型，主要是通過跳蚤叮咬傳播，表現(xiàn)為局部淋巴結腫大，可以出現(xiàn)紅、腫、熱、痛。嚴重的患者可以出現(xiàn)局部破潰，細菌可以入血，引起繼發(fā)性敗血癥和繼發(fā)性肺鼠疫。
第二、肺鼠疫，分為原發(fā)性的肺鼠疫和繼發(fā)性的肺鼠疫。原發(fā)性的肺鼠疫主要是由于肺鼠疫的患者，通過呼吸道飛沫而傳播，繼發(fā)性的肺鼠疫主要是繼發(fā)于腺鼠疫。
第三、敗血癥型鼠疫，主要是由于跳蚤叮咬之后，鼠疫桿菌可以直接入血，引起原發(fā)性的敗血癥型鼠疫。繼發(fā)性的敗血癥型鼠疫主要是由于腺鼠疫，或者肺鼠疫發(fā)展而來。
此外，還有其它的臨床類型，比如皮膚鼠疫、腸鼠疫、眼鼠疫，還有腦膜腦炎型鼠疫、扁桃體鼠疫，這些臨床類型相對比較少見。